DICOM je zkratka pro Digital Imaging and Communications v medicíně a je to mezinárodní otevřený obrazový formát pro manipulaci, ukládání, tisk a přenos informací v lékařských snímcích.
Lékařské snímky se používají při identifikaci a vyšetřování fyzických zranění a nemocí pomocí postupů, jako je rentgen , CT skenování atd.
Tento článek uvádí nejlepší bezplatné linuxové aplikace používané pro zpracování obrázků generovaných zařízeními DICOM.
1. Amide
Amid je multiplatformní nástroj GTK+ pro prohlížení, registraci a analýzu souborů objemových lékařských zobrazovacích dat. Využívá grafické uživatelské rozhraní s dlouhým seznamem funkcí včetně načítání více datových sad najednou, generování prolétávajících filmů jako souborů MPEG1, průvodce anizotropním filtrováním, nezávislé a hromadné prahování datových sad atd.
AMIDE – Medical Imaging Data Examiner
2. DicomBrowser
DicomBrowser je open source DICOM založený na Javě aplikace inspektor a modifikátor metadat. Byl vyvinut Neuroinformatics Research Group Washingtonské univerzity, aby byl vynikající v dávkové anonymizaci.
Je multiplatformní, dokáže současně načíst tisíce obrázků a také obsahuje rozhraní příkazového řádku pro anonymizační skriptovací stroj.
DicomBrowser – Zobrazení a úprava metadat DICOM
3. 3DimViewer
3DimViewer je multiplatformní lehký 3D prohlížeč datových sad DICOM napsaných v C++. Jedná se o open source se sadou funkcí, která zahrnuje ortogonální a multiplanární XY, XZ a YZ pohledy, nastavitelné okno hustoty, import více datových sad DICOM, 3D vizualizaci CT a MRI skenů, povrchové modelování libovolné segmentované tkáně, 3D vykreslování povrchu, atd.
3DimViewer- 3D prohlížeč lékařského DICOM
4. dcm4che
Na rozdíl od ostatních titulů v tomto seznamu dcm4che je sada vysoce výkonných aplikací na bázi Java shromážděných pro zdravotnické podniky a je používána po celém světě výzkumnými pracovníky v open source i komerčních aplikacích.
dcm4che umožňuje uložit jakýkoli typ objektu DICOM ve standardních souborových systémech s plnou podporou modelu klient/server PACS, DICOM IOD, více platforem a několika integračních profilů IHE.
Mezi jeho funkce patří také webové GUI pro administrátory, integrovaný server HL7, který může mimo jiné pracovat s typy zpráv ADT, ORU a ORM.
DCM4Che – Sbírka aplikací pro IT zdravotnictví
5. XMedcon
XMedcon je sada nástrojů a knihovna pro konverzi lékařských snímků s otevřeným zdrojovým kódem vyvinutá především pro konverzi rekonstruovaných nukleárních lékařských snímků.
Můžete jej použít ke čtení nepodporovaných souborů bez komprese, načtení nezpracovaných binárních/ASCII obrazových polí, k tisku hodnot pixelů, k zápisu PNG pro desktopové aplikace a k extrahování/změně pořadí specifikovaných obrázků mimo jiné.
XMedcon – Medical Image Conversion Toolkit
6. Aeskulap
Aeskulap je lékařský prohlížeč obrázků, který byl vytvořen jako open source alternativa ke komerčním DICOM prohlížečům a je založen na glademm, gtkmm a gconfmm.
Může načíst sérii obrázků DICOM ke kontrole a také je načíst z archivačních uzlů (aka PACS) přes síť.
Aeskulap – DICOM Image Viewer
7. Mango
Mango je zkratka pro Multi-image Analysis GUI a poskytuje nástroje pro analýzu obrazu spolu s pohodlným GUI pro navigaci.
Lze jej použít pro úpravy ROI, skládání obrázků, statistickou analýzu, vykreslování povrchu atd. Můžete také přizpůsobit filtry, tabulky barev, formáty souborů, pracovat s pluginy a analyzovat další formáty obrázků, jako je MINC, NEMA-DES, NIFTI a NIFTI2.
Mango – GUI analýzy více obrázků
8. 3D Slicer
3D průřez je multiplatformní integrovaná aplikace s bohatými funkcemi pro zpracování snímků, lékařskou obrazovou informatiku a 3D vizualizaci určená pro klinické výzkumníky, lékaře a počítačové vědce.
3D slicer můžete použít pro sofistikované ruční úpravy, automatickou segmentaci, analýzu a vizualizaci zobrazovacích dat difúzního tenzoru, čtení a zápis obrázků DICOM a dalších formátů, dávkové zpracování pomocí filtrace EMSegment BatchMake atd.
3D Slicer – Analýza obrazu a vědecká vizualizace
9. SMILI
SMILI (vyslovováno „smajlík“) je lehká a multiplatformní knihovna s otevřeným zdrojovým kódem obsahující sadu tříd pro vytváření aplikací pro zpracování lékařských snímků a vědecké vizualizace.
Obsahuje jednoduché grafické uživatelské rozhraní a rozhraní CLI se standardními algoritmy zpracování pro vyhlazování, prahování, maskování atd. obrázků a modelů.
SMILI – Simple Medical Imaging Library Interface
10. openDICOM.NET
openDICOM.NEt je projekt, který implementuje zcela nový přístup ke knihovnám DICOM. Je napsán v C# a obsahuje opendicom-utils pro práci s datovými slovníky v různých formátech.
Mezi jeho funkce patří stromové zobrazení obsahu ACR-NEMA a DICOM, podpora exportu obrázků ACR-NEMA a DICOM do různých formátů obrázků, zobrazení obrázků s podporou jednoho a více snímků, cyklování snímků známé jako filmový režim, úplná data DICOM 2007 a UID slovníky atd.
openDICOM.NET
11. Kradview
Kradview je NMR, DICOM a X-ray kompatibilní zobrazovací zařízení vytvořené pro platformy podobné Unixu. Jeho účelem je usnadnit vykreslování obrázků DICOM bez ohledu na jejich velikost a úroveň přiblížení.
Původně jej vyvinul David Santo Orcero jako součást svého doktorandského projektu a David del Rio Medina jej aktualizoval, aby měl lepší výkon při vykreslování.
Kradview – Prohlížeč rentgenových snímků
Máte nějaké zkušenosti s výše uvedeným softwarem? Nebo možná znáte další spolehlivé tituly, které můžeme přidat do našeho seznamu. V sekci níže můžete přidat své návrhy a dotazy.
A nezapomeňte tento článek sdílet všude, kde to bude užitečné.