omezení využití paměti v R pod linuxem

?"Memory-limits" doporučuje použít ulimit nebo limit .

Existuje příznak příkazového řádku:--max-mem-size který může nastavit počáteční omezit. Tuto hodnotu může uživatel během relace zvýšit pomocí memory.limit .

Je tam unix::rlimit_as() což umožňuje nastavit limity paměti pro běžící proces R pomocí stejného mechanismu, který se také používá pro ulimit ve skořápce. Windows a macOS nejsou podporovány.

V mém .Rprofile Mám

unix::rlimit_as(1e12, 1e12)

k omezení využití paměti na ~12 GB.

Před tím...

Vytvořil jsem malý balíček R, ulimit s podobnou funkcí.

Nainstalujte jej z GitHubu pomocí

devtools::install_github("krlmlr/ulimit")

Chcete-li omezit dostupnou paměť na R na 2000 MiB, volejte:

ulimit::memory_limit(2000)

Nyní:

> rep(0L, 1e9)
Error: cannot allocate vector of size 3.7 Gb