jak správně použít $1 v aliasu se dvěma argumenty

Nemůžete tímto způsobem používat aliasy, ale můžete definovat funkci, která dělá totéž.

function gd() {
    gvimdiff $1 dir/$1
}

Aliasy takto nefungují. Měli byste být schopni používat nahrazování historie (např. !!:1 ), (ne, bash to neumožňuje) nebo místo toho definujte funkci.