Řešení 1:
Chyby "operace není povolena" mě nutí přemýšlet, zda se NTP pokouší hovořit nebo otevřít svůj privilegovaný port (123), ale neběží jako root.
Můžete potvrdit, že buď NTP běží jako root, nebo je spuštěna verze s příslušnými oprávněními k otevření portu 123?
Řešení 2:
Jsou v /var/log/messages nějaké zprávy ntpd? Když jsem se zabýval svými problémy s EC2 NTP, všiml jsem si, že NTP neměl rád přílišnou synchronizaci a chtěl jsem ruční aktualizaci. Možná jste příliš daleko na to, abyste se rozhodli, že bude aktualizace provedena za vás.