Bash:provádění příkazů z chrootu a přepnutí uživatele

chroot /chroot_dir /bin/bash -x <<'EOF'
su -
./startup.sh
EOF

základní možnost:

cat << EOF | chroot /chroot_dir 
touch aaaaa
touch bbbbb
EOF

možnost s jiným shellem (např. pokud používáte bash, ale v chrootovaném prostředí neexistuje)

cat << EOF | chroot /chroot_dir /bin/sh
touch aaaaa
touch bbbbb
EOF

zkuste

chroot /chroot_dir /bin/bash -c "su - -c ./startup.sh"