Můžete použít ext2 . Podpora pro ext2 ve FreeBSD nějakou dobu existuje a pravděpodobně jej lze považovat za stabilní. Samozřejmě je nativní v GNU/Linuxu, jak víte.
Můžete také použít ext3 ale bez žurnálu a rozšířených atributů (použijte možnosti připojení v Linuxu /etc/fstab ), což by zvýšilo některé limity.
To je pravděpodobně mnohem lepší než použití fs, které není nativní na žádném ze dvou systémů, jako je NTFS a podobně.
Zdroj:https://www.freebsd.org/doc/handbook/filesystems-linux.html