Řešení 1:
Můžete mít potíže s přepínáním mezi Windows a Linuxem. Možná budete chtít využít nástroje pro správu konfigurace, jako je bcfg2 a puppet.
Také bych doporučil věnovat čas přečtení www.infrastructures.org, brilantnímu popisu rozsáhlých technik správy Linuxu. Jsem si jistý, že některé nápady by mohly platit pro vaši situaci.
Řešení 2:
Neexistuje žádný produkt jako Zásady skupiny pro všechny distribuce (např. fedora nebo ubuntu). Existují exkluzivní řešení (podobná Microsoft WSUS) pro každou distribuci:jako Landscape pro Ubuntu nebo RHN pro RedHat, ale tato řešení jsou placená a zaměřují se na aktualizace, monitorování a opravy serverů.
Můžete použít omezení nebo limity na Ubuntu (věřím, že fedora nebo jiná distribuce, která také používá Gnome) s řešeními, jako je Sabayon, k definování profilů plochy. Ale AFAIK, tato řešení nejsou centralizovaná.