Zjednodušeně řečeno:
- Mezi FAT a FAT32 stačí vybrat FAT32.
- Mezi NTFS a FAT32, pokud používáte disk pouze ve Windows, použijte NTFS. V každém jiném případě použijte FAT32.
Proč NTFS pro Windows?
-
Systém souborů NTFS (New Technology File System) byl zaveden systémem Windows a je podporován již od prvních verzí systému Windows. Takže se to stalo něco jako Windows.
-
Je nativní systém souborů pro Windows NT, Windows 2000 a Windows XP.
- Umožňuje indexování, které zlepšuje vyhledávání souborů (většinou rychlejší); způsobí mírný zásah do výkonu (může se vypnout).
- Má lepší zabezpečení – jako je šifrování podle souborů (nepodporuje Windows XP Home edition) a pravidla přístupu pro jednotlivé uživatele (můžete zabránit manželce, aby viděla složku porn!)
- Podporuje uživatelské kvóty (zabraňuje násilníkům stahovat příliš mnoho souborů MP3)
- Má kompresi podle souborů.
- Je žurnálován, což snižuje ztrátu dat (ScanDisk při spuštění není potřeba).
- Používá názvy souborů Unicode (umožňuje cizí a rozšířené znaky) a nativně podporuje dlouhé názvy souborů.
- Podporuje větší soubory než FAT (větší než 4 GB).
- Umožňuje větší objemy (větší než 1 TB). Hovoří se o teoretické hranici 16 exabajtů a až 2 terabajty.
- Podporovaný formát na dynamických discích (žádné dynamické disky v systému Windows XP Home).
- Funguje dobře s velkou mezipamětí (systémy větší než 96 MB).
- Lepší výkon na svazcích ~20 GB a více.
- Je prostorově efektivnější na velkých svazcích (větších než 8 GB).
- Odolné vůči fragmentaci.
Proč FAT32 pro Linux?
- FAT32 funguje dobře téměř všude. [FAT32 není ani výchozí souborový systém v Linuxu (na rozdíl od NTFS a Windows)]
Windows standardně formátuje USB disky jako NTFS, FAT je opravdu starý a jaký typ souborového systému chcete použít, záleží na vašich potřebách.
NTFS
- Podporuje soubory větší než 4 GB
- Lze spustit Windows 8 živě
- UNetbootin nedělá podporují NTFS a odmítá používat disky naformátované na NTFS.
FAT32
- Soubory musí být menší než 4 GB
- Linux Live funguje
Uvědomte si prosím, že v zařízení USB můžete mít několik oddílů, a proto můžete mít oddíl NTFS a FAT32.
Doporučuji použít UDF, které má zhruba stejné výhody jako NTFS zmíněný v odpovědi @Hele. Největším důvodem pro použití UDF místo NTFS je kompatibilita s OS X. OS X umí pouze číst ale ne zapisovat do oddílů NTFS. UDF je dobře podporováno, čtení i zápis v systémech Windows¹, OS X a Linux.
Chcete-li naformátovat jednotku jako UDF, viz:
- Použití UDF na USB flash disku
- Jak naformátovat jednotku flash jako UDF ve Windows 7?
¹ Kromě systému Windows XP, který podporuje UDF pouze pro čtení